Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTBN1Q01082 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms