Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD3P84022 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMAD3P84022 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms