Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COG7P83436 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COG7P83436 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COG7P83436 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COG7P83436 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COG7P83436 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COG7P83436 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COG7P83436 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COG7P83436 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COG7P83436 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms