Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX6P78412 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX6P78412 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX6P78412 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX6P78412 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX6P78412 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX6P78412 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX6P78412 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX6P78412 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX6P78412 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX6P78412 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX6P78412 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX6P78412 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX6P78412 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX6P78412 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms