Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPZ1P61923 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPZ1P61923 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms