Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAP25P60880 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms