Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVFC1-1P60608 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVFC1-1P60608 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms