Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FXYD4P59646 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FXYD4P59646 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms