Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM3BP58499 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM3BP58499 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FAM3BP58499 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FAM3BP58499 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FAM3BP58499 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FAM3BP58499 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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