Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIK1P57059 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIK1P57059 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK1P57059 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK1P57059 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK1P57059 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK1P57059 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK1P57059 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK1P57059 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK1P57059 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK1P57059 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK1P57059 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK1P57059 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK1P57059 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIK1P57059 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIK1P57059 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIK1P57059 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIK1P57059 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIK1P57059 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIK1P57059 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIK1P57059 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK1P57059 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK1P57059 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK1P57059 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK1P57059 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK1P57059 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK1P57059 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK1P57059 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIK1P57059 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms