Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFDNP55196 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFDNP55196 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFDNP55196 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFDNP55196 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AFDNP55196 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AFDNP55196 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AFDNP55196 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFDNP55196 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFDNP55196 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AFDNP55196 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFDNP55196 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFDNP55196 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFDNP55196 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFDNP55196 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFDNP55196 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFDNP55196 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFDNP55196 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFDNP55196 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFDNP55196 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFDNP55196 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFDNP55196 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFDNP55196 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFDNP55196 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFDNP55196 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFDNP55196 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFDNP55196 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFDNP55196 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFDNP55196 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFDNP55196 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFDNP55196 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms