Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP12AP54707 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP12AP54707 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms