Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNB3P54284 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB3P54284 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms