Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IST1P53990 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IST1P53990 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IST1P53990 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IST1P53990 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IST1P53990 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms