Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMTNP53814 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMTNP53814 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMTNP53814 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMTNP53814 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMTNP53814 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMTNP53814 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMTNP53814 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMTNP53814 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMTNP53814 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMTNP53814 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMTNP53814 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMTNP53814 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMTNP53814 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMTNP53814 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms