Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSBP53539 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSBP53539 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSBP53539 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOSBP53539 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSBP53539 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSBP53539 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms