Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACLYP53396 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACLYP53396 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACLYP53396 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACLYP53396 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACLYP53396 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ACLYP53396 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACLYP53396 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACLYP53396 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACLYP53396 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACLYP53396 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACLYP53396 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACLYP53396 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACLYP53396 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACLYP53396 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACLYP53396 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACLYP53396 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms