Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA3P52797 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA3P52797 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms