Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA2P51531 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms