Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ETV1P50549 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ETV1P50549 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ETV1P50549 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ETV1P50549 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ETV1P50549 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms