Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TTPAP49638 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TTPAP49638 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TTPAP49638 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TTPAP49638 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TTPAP49638 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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