Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FNTBP49356 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FNTBP49356 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FNTBP49356 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FNTBP49356 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FNTBP49356 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FNTBP49356 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FNTBP49356 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTBP49356 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTBP49356 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTBP49356 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms