Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAD52P43351 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms