Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRPPRCP42704 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRPPRCP42704 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRPPRCP42704 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRPPRCP42704 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRPPRCP42704 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRPPRCP42704 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRPPRCP42704 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRPPRCP42704 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRPPRCP42704 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRPPRCP42704 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRPPRCP42704 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LRPPRCP42704 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms