Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CEACAM3P40198 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms