Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGAEP38570 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGAEP38570 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms