Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6V1E1P36543 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP6V1E1P36543 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms