Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT2P35908 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT2P35908 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT2P35908 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT2P35908 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT2P35908 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT2P35908 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT2P35908 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms