Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPB2P35606 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPB2P35606 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPB2P35606 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms