Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RORAP35398 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RORAP35398 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RORAP35398 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RORAP35398 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RORAP35398 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RORAP35398 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RORAP35398 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RORAP35398 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RORAP35398 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RORAP35398 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RORAP35398 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RORAP35398 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RORAP35398 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RORAP35398 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms