Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTNNB1P35222 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNB1P35222 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms