Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM5P33992 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM5P33992 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM5P33992 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM5P33992 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM5P33992 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms