Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRS3P32247 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRS3P32247 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRS3P32247 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRS3P32247 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRS3P32247 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms