Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOBEC3AP31941 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms