Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA7P31268 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms