Protein–RNA interactions for Protein: P30305

CDC25B, M-phase inducer phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25BP30305 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC25BP30305 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms