Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP1P29466 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP1P29466 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP1P29466 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP1P29466 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP1P29466 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP1P29466 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP1P29466 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP1P29466 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP1P29466 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP1P29466 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP1P29466 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP1P29466 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP1P29466 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP1P29466 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP1P29466 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP1P29466 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP1P29466 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP1P29466 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP1P29466 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP1P29466 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP1P29466 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP1P29466 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP1P29466 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP1P29466 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP1P29466 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms