Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID4AP29374 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID4AP29374 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms