Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHC1P29353 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHC1P29353 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHC1P29353 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHC1P29353 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHC1P29353 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHC1P29353 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHC1P29353 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHC1P29353 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHC1P29353 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHC1P29353 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHC1P29353 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHC1P29353 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHC1P29353 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHC1P29353 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHC1P29353 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHC1P29353 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHC1P29353 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHC1P29353 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHC1P29353 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHC1P29353 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHC1P29353 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHC1P29353 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHC1P29353 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHC1P29353 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms