Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms