Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2AP24928 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2AP24928 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms