Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRGP23470 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRGP23470 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
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