Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGS1P23219 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms