Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD247P20963 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD247P20963 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CD247P20963 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD247P20963 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD247P20963 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms