Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4BPBP20851 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4BPBP20851 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms