Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HNF1AP20823 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HNF1AP20823 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNF1AP20823 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNF1AP20823 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNF1AP20823 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNF1AP20823 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNF1AP20823 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNF1AP20823 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HNF1AP20823 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HNF1AP20823 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms