Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC9A1P19634 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms