Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC3P19447 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC3P19447 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms