Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

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Length 629 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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