Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GNB3P16520 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GNB3P16520 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GNB3P16520 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms